而「最後任務」則是這次遊戲新加入的部分,玩家在遊戲時就算沒有「X-2」的過關記錄也能玩,但如果有過關紀錄的話,便可以從結局後約3個月的史皮拉進行故事冒險。而這次三人組最後冒險的舞台是一個高聳的「ヤドノキの塔」,這座塔為最近發現的巨大遺跡,不但巨大且構造複雜,如果能登上塔頂將會有好事發生。另外遊戲中也將新增加幾件新服裝登場,像是可以引發不可思議現象的超能力裝「Psi-Kicker」等,因此對於之前已經玩過本作的玩家來說應該也將可以得到與之前不同的樂趣才是。
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