除此之外,本作在遊戲模式方面主要將分成兩種不同類型,分別是延續「機動戰士鋼彈Seed」的故事推進,同時除了將有原作精彩畫面重新再現之外,還將會以全語音方式表現,帶領玩家再度體驗「鋼彈Seed」豐富故事設定的「Seed」模式;以及收錄歷代著名戰役為舞台,玩家可以以本系列所熟悉的模式來編成自己的部隊進行戰鬥,而且本作還將預定把包括「Astray」的角色與機體也一併加入其中的「Generation」模式;另外遊戲中還導入為初學者玩家設定的簡易編成系統,讓玩家體驗更加簡單有趣的「鋼彈Seed」樂趣。
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