魔幻騎士採用ATB PLUS戰鬥系統。當角色集氣完畢後，玩家就可以下達指令，發動攻擊或防禦。集氣速度依照角色的敏捷屬性而變化，集滿氣後，可以發動攻擊、也可以下達「待機」指令，等待其他的角色集滿氣，發動「變身神魔」的魔法攻擊。且主角還擁有「捕捉」技能，能夠在戰鬥時捕捉怪物，變成我方一項有用的資源。怪物不但能夠變賣來換錢，又可以供奉給「召喚神魔」，加強神魔威力，還可以拿來作「魔化」裝備。
所謂的「魔化裝備」，就是把物品欄位中的怪物、以及想要魔化的裝備，交給武器店的店家，加付一筆金額，請店家將怪物轉化附加到裝備之上。可魔化的物品包括武器、防具等。這些東西在魔化後，不但威力增加，且具有附加怪物的屬性，用來打倒屬性相剋的怪物時，攻擊力會大幅提高。裝備雖然可以魔化多次，但有上限的存在，已經到達魔化上限的裝備無法魔化，值得注意的是，使用高階與低階的怪物來魔化裝備會有極大的差別，這是進行魔化時不可不小心的地方。
