正當東京街頭充滿萬聖節氛圍時，澀谷 HIKARIE 正在舉行婚禮，而婚禮現場有著身穿禮服的佐藤刑警。正當柯南一行人在現場觀察著來賓時，現場突然闖進了一名暴徒，而為了保護大家的高木刑警卻因此身陷危機？！雖然後來事件安全落幕，但佐藤卻回想起了 3 年前的連續爆炸案件，而當時殉職的松田刑警恰巧與高木刑警的身影重疊。
與此同時，連續爆炸案件的犯人逃獄了，究竟這一連串的事件純粹是巧合還是另有隱情？公安警察的降谷零（安室透）為了前往追捕逃獄的犯人，卻被神秘的偽裝男子戴上了頸圈炸彈。為了將炸彈解除而潛伏的降谷零，與柯南談起了偽裝男子以及 3 年前的事件，但隨著他們逐漸朝著真相前進，潛伏在黑暗的陰謀躍然而出。
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