玩家在遊戲中扮演主角宇宙，與一同修行的齋天、麻鈴因為偷偷開發能夠侵入夢中「寶貝」，而使妖魔入侵人間，為了替自己的過錯負責，並追查妖魔入侵人間的原因，消滅妖魔而展開的不可思議冒險旅程。
而這群原創的人物也在遊戲中遇到封神榜的眾英雄，發現這一切與九尾妖狐妲己即將復活有關，而與封神榜眾英雄一同參予封神任務。
「魔法封神」最大樂趣在於研發各種寶貝，各種動植物、礦物、原料都能加以合成「寶貝」，擁有不可思議的魔力。遊戲也支援4名玩家透過GBA對戰線連接對戰，交換彼此的原料或一起合成更強力的寶貝。
此外「魔法封神」最大賣點是能跟NGC版動作遊戲「戰鬥封神」連結互動，在GBA上得到的寶貝能上傳到NGC上讓遊戲執行更方便，這是個有趣的點子喔!!
