而在個人獎的部份，則評估了由去年（2007 年）8 月至 2008 年 7 月之間表現最為顯著的業界工作者，其中由曾擔任電視動畫《電腦線圈》的監督、原作與腳本的磯光雄獲獎。而今年的特別獎，頒給了多年以來對動畫業界的貢獻非凡的 辻真先。
第 13 屆神戶動畫獎的頒獎典禮預計在 11 月 2 日舉行，以下為今年度的得獎名單：
˙個人獎：磯光雄（導演）
˙特別獎：辻真先（作家、脚本家）
˙作品獎（電影動畫）：《福音戰士新劇場版：序》
˙作品獎（電視動畫）：《Code Geass 反叛的魯路修 R2》
˙作品獎（網路分類）：初音未來
˙主題曲獎：「トライアングラー」（演唱者 : 坂本真綾《超時空要塞 Macross》OP）
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| 磯光雄 | 初音未來 | 坂本真綾 | 辻真先 | 《反叛的魯路修 R2》 |
