《世紀末超自然學院》作品以「私立法爾特修坦學院」作為舞台，總是有各種超自然的不可思議現象發生的該校，於是被眾人稱為「超自然學院」。校內除了賭上性命研究這些超自然現象的校長外，學生們也日以繼夜的研究這些奇妙現象。
某日，超討厭超自然現象的女主角「神代麻耶（神代マヤ）」，因為父親、同時也是該校校長的去逝而來到學院，並結識了自稱是來自 2012 的少年「內田文明」。文明和麻耶將遇上校園中發生的各種事件，進而發現文明來到過去的真相。
 |  |
參與作品演出的聲優包括 日笠陽子、水島大宙、茅原實里、子安武人、高垣彩陽…等人，《世紀末超自然學院》預計將於 7 月 5 日（週一）起在日本開始播映。
