《神奇寶貝圖鑑 3D》是專為 N3DS 打造的 3D 立體圖鑑，收錄來自《神奇寶貝 黑版 / 白版》超過 150 種新登場神奇寶貝的資料與招式。
一開始會開放 16 隻神奇寶貝供玩家查詢，後續可透過掃描 QR 二維條碼或是不知不覺連線（每天隨機開啟 3 隻）來增加，或透過擦身而過連線與其他玩家交換各自擁有的神奇寶貝。
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透過 N3DS 的裸視 3D 液晶螢幕，玩家將能見識到真實 3D 呈現的神奇寶貝，可 360 度自由旋轉從不同角度觀賞。支援擴增實境功能，可拍攝各種讓神奇寶貝融入真實環境的趣味相片。
N3DS《神奇寶貝圖鑑 3D》預定 6 月隨「任天堂電子商店」同步上線，免費提供。
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