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本作的故事，是從玩家所扮演的方舟新人即將降落在行星那貝利烏斯（ナベリウス）前夕展開。劇情任務只要滿足特定條件就會陸續解開，而為了達成解開的條件就必須完成「主線任務（マターボード）」了。在遊戲開始之後，會從 NPC「紫音（シオン）」那邊得到一樣道具，只要完成上面顯示的「主線（マター）」就可以承接新的劇情任務了。
在這次公開的故事當中，第一章有些部分是之前封閉測試中的內容，不過在先行公開測試之後將會有新的發展在等著玩家。到底是什麼樣的故事呢，大家就趕快來搶先看看吧。
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◆ 劇情：介紹到第 4 章為止的故事大綱
● 第 1 章「一直在等待著明天」
接受在方舟船內認識的「紫音」委託，再度來到行星那貝利烏斯。但並沒有具體的委託內容，她只說「希望你能到那貝利烏斯」這樣而已。在那邊有什麼在等待著玩家呢，關於這點也沒人知道。
※ 我想有很多人已經在 CBT 體驗過第 1 章了，不過在先行公開測試之後還會有不一樣的發展。
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● 第 2 章「氣氛怪異的那貝利烏斯」
接受了對於行星那貝利烏斯的形成抱持著疑問的學者「羅吉歐（ロジオ）」的委託，來到了那貝利烏斯。任務的目的是想要在穿越森林之後，遼闊的凍土大地的資料。但是那邊似乎已經有人先到了。
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羅吉歐
配音：白鳥 哲
種族：人類
性別：男
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調查行星的組成跟地質等的學者。
因為沒有成為方舟的資格，所以情報都是經由委託來取得的。
對於行星那貝利烏斯的形成感覺到違和感，便委託玩家去收集情報了。
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● 第 3 章「在沙塵之中」
在被沙漠包覆著的行星利里巴砂漠中，一直有目擊到小影子的情報送來。自稱是「芙莉葉（フーリエ）」的機械人也強調自己是被小影子所救。接受她的委託之後，便來到了利里巴，一起尋找小影子的痕跡。但機甲種的動作非常迅速...
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● 第 4 章「龍之病」
前往強壯的龍族所居住的行星阿姆特斯基亞中的火山洞窟，身為研究者以及方舟的「亞奇（アキ）」跟她的助手「萊特（ライト）」也一起來了。因為龍族可以自己擊退達卡（ダーカー）的關係所以拒絕幫助方舟，而亞奇說最近狂亂的龍族實在是增加的有點多。
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◆ 介紹《PSO2》世界中豐富的角色群！
在《PSO2》的世界中不是只有在劇情任務會遇見而已，也會在方舟・大廳跟任務中等等各種地方遇見這些角色。他們都有自己的目的，以神諭活動著。除此之外還有很多角色會出現。跟看起來不是很重要的角色對話偶而也會變成關鍵。
故事將會定期釋出，可別錯過了。
● 傑諾（ゼノ）
配音：木村良平
種族：人類
性別：男
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是名優秀的方舟成員。很會照顧人，就像是個大哥似的。
雖然講起話來有點隨便，但有著無法放著有煩惱的人不管的一面看到有煩惱的人。
這些都是以前曾經照顧過他的「師父」教他的樣子。
因為受到前輩們喜愛經常會委託他一些工作。
雖然本人覺得很麻煩，但並不會拒絕。
● 艾可（エコー）
配音：日笠陽子
種族：新人類
性別：女
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與傑諾一起活動的方舟女成員。自稱是傑諾的保護者。
雖然很努力的作出像前輩的樣子，但經常會顯露出缺點。
是個有點天然呆又粗心的女生。
因為傑諾當上了那自己也要，成為了她想成為方舟的動機。
雖然不知道這個理由是不是真的，不過在傑諾旁邊的話實力略顯不足。
● 亞分（アフィン）
配音：下野 紘
種族：新人類
性別：男
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與玩家是同期的方舟成員。初次見面就稱玩家為夥伴了。
他是個認真又親切，但又有點膽小的普通少年。
成為方舟的理由好像不是為了打倒達卡，而是要找某種東西似的。
並不喜歡戰鬥。
● 紫音（シオン）
配音：緒方恵美
種族：人類？
性別：女
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時常帶著憂鬱的表情站在在商店區中心部的女性。
因為不太會顯露出感情，言行舉止也很僵硬，讓人不太好理解她想要表達的意思。
但她本人其實很努力的想要表達出自己的意思。
她會對玩家以像是懇求的態度給予可以進行主線任務的道具。
但她究竟想要做什麼，目前還不得而知。
● 瑪德依（マトイ）
配音：佐藤聰美
種族：人類？
性別：女
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在行星那貝利烏斯出現大量達卡時受到保護的少女。
她失去了記憶，只記得一個人的名字記憶。
雖然很不擅長跟人交流，但好奇心十分旺盛。
對於各種情報都感覺到新鮮，會很開心的去觀察。
● 菲莉亞（フィリア）
配音：植田佳奈
種族：人類
性別：女
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她是在入境區中的醫療中心裡的人員。
很擔心受到保護的瑪德依，經常會陪在她身邊，是一名非常溫柔的看護。
因為想要幫助瑪德依恢復記憶，而從各方面協助著她。
● 蓋德姆哈爾特（ゲッテムハルト）
配音：飛田展男
種族：人類
性別：男
他是一名惡名遠播的武鬥派方舟成員。喜歡與強敵戰鬥，打倒對方的話會讓他非常開心。
對於達卡的鬥爭心非常強烈，只要認為對方有侵略的意思就會毫不猶豫的殲滅對方。
他完全不和任何人交流，但唯有梅爾芳席娜是他唯一認可的。
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● 梅爾芳席娜（メルフォンシーナ）
配音：花澤香菜
種族：新人類
性別：女
跟在蓋德姆哈爾特身邊的嬌小女生。她對蓋德姆哈爾特十分尊敬，不管有多辛苦的事情都會跟著。
雖然寡言但十分有禮，帶給人文靜的印象，但只要扯上蓋德姆哈爾特的話就會變得不留情面。
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● 帕蒂（パティ）
配音：阿澄佳奈
種族：新人類
性別：女
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自稱方舟情報組姊妹，是雙胞胎中的姐姐。
她最大的特徵就是有著異常高昂態度。只要有想說的話就會講出來。
對於最近認識的新人方舟成員因為都會乖乖聽她說話所以十分滿意。
偶而會說出非常正確的判斷，有時也會得到非常不得了的情報。
就某種意義來說很適合當情報員。
● 蒂雅（ティア）
配音：井口裕香
種族：新人類
性別：女
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是雙胞胎中的妹妹，雖然自稱為情報組姊妹，不過真的在收集情報的都是由蒂雅在進行。
跟姐姐對照之下顯得比較沉穩，不過提出反論的時候口氣會十分刁鑽。
當姐解說出來的話有誤的時候，都是由她來負責修正的。
● 芙莉葉（フーリエ）
配音：金元壽子
種族：機械人
性別：女
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個性像好孩子，有著勇往直前跟純樸性格的方舟成員。
既老實又純樸，又有些天然呆。
當他受到挫折的時候會馬上重新站起來，比一些笨拙的人類更有情緒。
因此也經常被說不像個機械人。
在行星利里巴曾被利里巴族的人救過，讓她覺得受到了很大的恩情。
她無論如何都想報答這份恩情，所以想要嘗試著各種方法來跟他們交流。
● 亞奇（アキ）
配音：渡邊久美子
種族：人類
性別：女
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是名方舟成員又身兼研究者的才女。
是一個只要對一件事情很深入時，就會不管週遭的類型。目前在研究行星阿姆特斯基亞中的龍族。
而她的研究對象就是關於龍族的凶暴化問題她從各方面進行調查，摸索著解決方法。
● 萊特（ライト）
配音：柿原徹也
種族：新人類
性別：男
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跟在亞奇身邊的助手。雖然他有方舟的資格，不過不常戰鬥。
為了支援沒有生活能力等等研究以外能力的亞奇，他每天都在四處奔走。
因為他很膽小，只要碰到可怕的事情就會提出快逃走的建言。
● 雷達（レダ）
配音：白鳥 哲
種族：新人類
性別：男
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才剛完成訓練任務的新人方舟成員。只要聽到傳聞就會馬上跟別人說。
因為還年輕的關係，感情上的起伏十分激烈，經常一下沮喪一下開心的。
雖然本質上他是個善良的人，不過因為輕浮的言行跟長相的關係時常遭到誤會。
● 約翰（ジャン）
配音：秋元羊介
種族：人類
性別：男
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長年都以方舟成員活動的老手。
他認為對年輕人以長年的經驗提出建議是自己的義務，只要開始講話就會很忘我的一直講下去。
因為實在是講太久了，有些人覺得很困擾。
不過他本人沒有任何惡意，他覺得這是件好事，所以沒有停下來的意思。
● 修依（ヒューイ）
配音：柿原徹也
種族：人類
性別：男
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在方舟中有著壓倒性的實力，是擁有絕對命令權的六人、六芒均衡的六。
通稱「想要隱藏起來的六芒均衡」。熱血個性及超強實力是他的招牌，不過因為聲音大所以很吵。
雖然他有實力，又溫柔，又非常有存在感，但又少根筋也很吵。
對於作不到的事情他會很努力的去作到，而這份努力的結果也讓他得到在六芒均衡裡的位置。
但他依然不忘繼續鑽研。
● 吉革（ジグ）
配音：立木文彦
種族：機械人
性別：男
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經常沒幹勁的站在商店區的機械人男性。
以前曾以頑固的刀匠而遠近馳名，也有許多方舟成員來跟他買武器。
不過最近失去了熱情，經常什麼都不作的來度過每一天。
● 戴歐特爾（テオドール）
配音：岡本信彦
種族：新人類
性別：男
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明明就不想當上方舟成員卻因為有才能而當上的少年。
所以在出任務的時候都沒什麼幹勁，經常都想要輕鬆帶過。
他有想要當上方舟成員卻當不上的朋友。
因此對當上方舟成員這件事情特別有罪惡感。
● 烏魯克（ウルク）
配音：伊瀬茉莉也
種族：新人類
性別：女
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雖然想成為方舟成員，但因為沒有才能所以無法當上。
但是她看起來一點都不沮喪，反而顯露出一點都不在意的開朗。
跟自己對照之下，她很擔心明明就沒興趣卻當上方舟成員的朋友。
◆ 委託任務（クライアントオーダー）
接受其他角色的委託，通過特定的任務或是在任務中收集他想要的東西為主要目的。。
因為過完這些委託都會有經驗值跟報酬，多玩委託任務的話會使得升級效率提高。
■ 遊戲初期推薦的委託任務序盤
首先就跟各職業的指導員角色講話，接受他們的委託看看吧。
他會借給玩家該職業的武器並且簡單的解說武器的使用方法。
只要打倒一定數量的敵人，他就會把武器送給玩家喔。
也就是說可以不用買，就可以得到所有種量的武器了。
● 委託內容：大劍的使用方法
委託人：歐薩（オーザ）（配音：下野 紘）
種族：人類
性別：男
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在入境區內的方舟成員，職業是獵人。
有著開朗的個性，也很會照顧人。
對獵人這個職業感到驕傲，很討厭因為體力過低時常陷入危險的術士。
歐薩會以獵人指導員的身分登場。
然後會一直跟玩家推薦獵人這個職業。
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● 委託內容：長槍是要這樣使用的唷
依頼者：麗莎 （配音：花澤香奈）
種族：機械人
性別：女
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在入境區內的方舟成員，職業是槍手。
深愛著槍類武器，最喜歡用槍擊來蹂躙對手。
因為講起話來實在是有點不太正常，雖然以方舟成員來說相當有實力，不過其他人則敬而遠之。
麗莎會以槍手的指導員身分登場。
非常危險的言行舉止讓她美中不足，但是她是一名有實力的槍手。
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● 委託內容：長杖的使用方法
依頼者：瑪爾（マールー）（配音：門脇舞以）
種族：新人類
性別：女
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在入境區裡的方舟成員。職業是術士。
不太會顯露出感情，很文靜也不太愛說話。
對於術士這個職業感到榮耀，而獵人因為會繞來繞去的會干擾到她，所以她不喜歡獵人這個職業。
瑪爾會以術士指導員的身分登場。
可以看到她最相信術士及最討厭獵人的一面。
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(C) SEGA
