任天堂於 2013 年 12 月 10 日起開放了任天堂 3DS／3DS LL 的主機機能資料更新（版本「7.0.0 －13 J」）。這次的資料更新的變更點如以下所示：
- 「任天堂 e 商店（ニンテンドーeショップ）」可以對應任天堂網路 ID（ニンテンドーネットワークID）
- 追加到現在為止只有 Wii U 能使用的 「Miiverse」機能
- 可以以任天堂 3DS／3DS LL 主機來進行任天堂網路 ID 的新增帳號・帳號登入・帳號設定等動作
- 任天堂 3DS／3DS LL 主機的軟體及資料移轉次數變更為沒有限制
- 關於軟體的「更新資料」的通知功能，在該軟體啟動時會通知玩家關於「更新資料」資訊的功能。
- 從主選單（HOMEメニュー）來啟動相機的啟動方法變更為［L］鈕與［R］鈕一起按下（原先的啟動方式為按下［L］鈕或［R］鈕）
- 系統的安定性及便利性的提升
備註標記的部分，為卡帶版資料更新時不會更新的部分，僅收錄於網路下載版本內的資料更新。此外，這次任天堂 3DS／3DS LL 的主機機能資料更新也收錄於遊戲軟體的卡帶內，但卡帶版的更新僅對應這次更新內容中一部分的功能更新，玩家們更新前請確認清楚。
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