對圍棋一竅不通的小學六年級學生進藤光，一日在爺爺家的倉庫發現古老的圍棋棋盤，因為能看得到棋盤上的血漬，而被藏身在棋盤內的古代靈魂藤原佐為附身。藤原佐為是平安時代的天才棋士，為了達到神乎其技的境界，而在世上徘迴千年，等待再次下棋的機會。
為了滿足佐為下棋的慾望，阿光特地帶佐為到碁會所下棋，因而打敗了同齡的天才棋士塔矢亮。塔矢亮是圍棋界第一人塔矢名人的兒子，自小受到父親的指導，棋力超越同齡對手許多，卻敗於受佐為指揮的進藤光。受此打擊的小亮，為了要追趕進藤光（佐為），努力磨練自己的棋藝。阿光被小亮認真的態度激勵，從而對圍棋產生興趣，在佐為的指導與修練下，最後進入職業圍棋界，與塔矢亮共同追求神乎其技的境界。
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