如同《金田一少年之事件簿》一樣，《偵探學園》與《感應少年EIJI》裡，也出現一些兇手的代號。
不過因為並非每個單元都會如此設定，加上兩部作品的集數比金田一少，所以就整理在同一篇文章裡了！
一、《偵探學園》
【開膛島之慘劇】：切り裂きジャック（開膛手傑克）→本單元並非真實案件，而是偵探學園入學考試最終題目
【殺人收藏者】：コレクター（收藏者）
【幻奏館殺人事件】：冥界のマエストロ（冥界的藝術大師）
【超能力殺人事件】：サイキック（超能力者）
2007年的短期復活連載單元都沒有兇手代號，而【神隱村殺人事件】故事裡，小Q等人是以「疫神教教祖」來稱呼兇手！
二、《感應少年EIJI》
【殺人鬼梅比斯】：メビウス（梅比斯）
【裝有定時裝置的蘋果】：アップル（apple）
【Silent Steaker】：サイレントストーカー（事件標題即為兇手代號）
【微笑的屍體】：ポイズン（poison）
【殺人鬼JUSTICE】：ジャスティス（JUSTICE）
【猶大的啟示錄】：ユダ（猶大）
【殺人主廚】：殺人シェフ（事件標題即為兇手代號）
【騷靈之館】：IMUTAN（伊姆丹）
【Cannanis】：カンナビス（事件標題即為兇手代號）
【Silent Bomber】：サイレント・ボマー（事件標題即為兇手代號）
【死亡遊戲】：MELA（也就是章吉收到的手機簡訊裡，自稱「芽衣羅」的女生）
新章的單元都沒有在對話裡出現兇手代號，在此就不提了！
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