看到原祖作的最初預定的結局集數，但劇情是否一開始便外星人打殘地球?
問過專版也沒有人回應，便只好當作一開始便要犧牲地球娘來完成杯具(悲劇)吧。
這十三集的大要
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就這時人類也發覺祖拿達軍的行動像分裂，觀眾從全知的角度便知道那個叫「金正」(中文維基譯「卡姆金」)カムジン，多次計劃消滅馬克羅斯。但因為他只是芝麻小將才沒成事。同時巴特贊派了一班女巨人協助布勒泰。
而作為統合軍實權者的司令大人的女兒，向老爸報告他們的發現，當然地球沒有人相信在太陽系附近，便有支數百萬艘的宇宙艦隊正在虎視。而司令向大家介紹了新兵器「超級大砲」(電視台譯名，香港vcd版譯無敵大砲)，可是未沙說這個像是玩具了。
而他們都以為馬克羅斯(超時空號)被外星人毀滅了，而對外公報便改成被反給合軍所炸掉。所以輝帶明美回她的故鄉時，當地人被很驚奇明美沒月死，而明美的表哥林介生(日文維基譯 鈴海皇)現身並宣揚自己的和平主義。結果明美在回艦時帶同表兄上機。
當地球有地方政府說要收容難民，而在經過城市無法反擊時，被金正隊趁機攻擊，雖然成功使用了新發明的全身防護罩，可最後反被刺激得引起超級爆炸，威力遠大過任何已知的核彈，把敵人前鋒連同經過的城市毀滅。
而在行動前福卡因為輕視所受的傷，而去和クロ－ディア(黑珍珠)約會中傷發陣亡，輝升級接替但柿崎也在上文事件中被捲入爆炸而死。事後馬克羅斯被逼帶難民再度上太空。
在巨人的間諜返回後所說的發現很驚人，當然他們也有些誤會，例如以為幻想電影是記錄片，像這好像北斗之拳嗎?
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但最要命的是巨人們被明美的歌聲所動搖了，有人拒絕對馬克羅斯進攻也有人叛變。而多次敗在麥斯手上的女巨人美娜，在縮小自己後見到真實的他後便愛上他和結婚了。在對於巨人時美娜教麥斯「不殺主義」，使到美娜的同袍不用死。
同時也在雙方檢查過對方的身體，才確認大家是同類。可是巴特贊決定消滅地球和他那支受到文化污染的前鋒部隊，便帶同基幹艦隊對地球實行毀滅性的攻擊，四五百萬艘的宇宙戰艦對地球奇襲下，守軍和在地上人類皆被害。
輝和明美皆親睟保衛地球失敗了，但仍然有一絲希望即明美的歌聲，可以救到馬克羅斯和拒巴特贊的巨人艦隊。
而未沙的父親等在地底的要塞，發射超級大砲反擊，雖然不足以打爆基幹要塞，卻給馬克羅斯留下一條通道衝向要塞。便以明美的歌聲引導下，給馬克羅斯使用反應彈(核彈)和上次的防護罩從內部攻擊基幹母艦，把巴特贊和他的要塞毀滅。
而在巨人艦隊向超級大砲所在的地方反擊下，司令被殺而剛巧輝被擊落救了未沙。在喪失戰意下基幹艦隊自行離開地球軌道，而條和未沙與降落的馬克羅斯重逢了。
建立了系列地位的故事後部
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在上文說起初超時空要塞作為軍事動畫，並沒有決定性的優勢和成功，當然看到這裡應當知道其結局的壯烈的戰鬥和地球被毀滅的悲劇結局，這地球比宇宙戰艦大和號還糟的。
(謎之聲有救世主拳四郎不怕巨人的)
可是此前靠的卻意外是:超美形的型造`時尚的服裝與髮型`日常生活的點滴`不合理過分華麗的變形機械`反烏托邦式的敵人生活世界觀`主角近乎必中和全閃的動作------
最後當然是非常好聽的歌曲，最重要的不是單給電視觀眾聽的，也是故事世界觀中的歌曲，對觀眾來說也不只是聽更是易上口易學唱的歌曲。
結果到第二十七集終於成全了三大機人動畫中的第二部，另兩部當然是gundam和eva了。
最後貼的視頻是罕見的電視版 ed runner的第二和第三個版，第一個版當然是碟版的藤原誠老師唱的。第二版和第三版是他和飯島真理合唱，和飯島真理獨唱的版了。
但最要命的是巨人們被明美的歌聲所動搖了，有人拒絕對馬克羅斯進攻也有人叛變。而多次敗在麥斯手上的女巨人美娜，在縮小自己後見到真實的他後便愛上他和結婚了。在對於巨人時美娜教麥斯「不殺主義」，使到美娜的同袍不用死。
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