屍山血河。
戰國末年，據傳是豐臣殘兵的彌五郎以菩薩山為據點，襲擊路上的旅客搶奪錢財。有次彌五郎襲擊了港口的一個小村莊，小村的居民全被殺死到剩下一個小孩，彌五郎要小孩倒酒並聽他的武勇故事。彌五郎喜歡小孩，但過不久就會殺了他再找下一個，這個僅存的孩子大概也看不到隔日的太陽吧，故事本會在這裡結束...卻在此時，路過的劍豪將山賊84人悉數斬殺，孩子也不知去向...
慶安四年
宮本伊織正在長屋外練劍，義妹的小笠原香耶來拜訪伊織。宮本伊織是劍豪宮本武藏的養子也是劍術的繼承人，香耶也是武藏的養女，目前在小笠原家生活，但伊織則是單身生活在江戶的幽靈長屋。
伊織熱衷於鍛鍊劍術，還曾經空腹練習到暈倒。現今已不是戰國時代能爭取戰功而有收入，伊織只能靠著江戶的同心隊員(類似警察)好友助之進接受委託賺取生活費。今日的委託是打倒品行不良的浪人，擊退他們時，浪人頭領還說著儀式之類的事情，任務完成後伊織的左手上出現了印記。
晚上明月照進長屋，在家的伊織看著手上的印記，本來打算要問紅玉老爺子，但決定先就寢好了。睡到一半，突然身穿黑色古鎧甲的武士打破天花板朝著伊織攻擊，屋外也出現了數名忍者。伊織於夜色中逃跑，即使擊退了眾多忍者，但依舊不敵鬼氣逼人的黑鎧武士Rider，伊織使用密藏的寶石魔術也無法對武士任何傷害。此時由井正雪出現，表示武士殺人前要報上名號，打算親手了結伊織時，伊織手上的印記發出強光，Saber出現在兩人之間。
Saber逼退了正雪並開始與Rider鏖戰，酣戰之時突然有第三人插手，手持兩把長槍的女戰士跟新的御主隨著黑色火焰現身，Rider組撤退，江戶長屋陷入火海，雙槍的Lancer和Saber在火海中戰鬥，意識到對方不會停手的Saber解開了寶劍的封印(水之鞘)打算使用寶具，伊織瞬間意識到那寶具的威力會將城鎮化為廢墟，在Saber準備發動前無意識的使用令咒要Saber停手，被中斷的Saber咳出血來，幸好此處只是無人居住的長屋，但威力削弱的寶具依舊將附近毀壞，閃過寶具的Lancer也趁機撤退。
之後在回程的途中Saber向伊織解釋盈月之儀(聖杯戰爭)的事情，但由於認為伊織太過弱小，並不打算告訴伊織真名。另一方面撤退的Rider組正在和陰陽師土御門泰廣密談，看來Saber是最後一位被召喚的從者了。回程時Rider組遇見了Lancer組，偷襲不成的Lancer，其御主地右衛門打算跟正雪聊聊過去的往事。
(註: 此處提到森宗意軒老師，森宗意軒曾經遠赴朝鮮、南蠻、中國與荷蘭等地，習得火術、外科與火攻等，在德川幕府建立後前往九州的天草島隱居。地右衛門從森宗意軒習得魔術，據傳正雪也是弟子之一。爾後森宗意軒於島原之亂戰死，地右衛門則是那個島原地獄的倖存者之一，也就是這份與基督教殉教的因緣才召喚出貞德吧。)
在長屋休息一晚的伊織，想起了武藏臨終前在靈巖洞對伊織和香耶所說的話...
當老夫只為劍而生時，正好是你這個年紀，
如果戰國亂是還在的話，老夫應該也不會變吧?
可是世界變了，那麼路也應該跟著變才是，
二天一流並不只是劍法，也是內心的呈現，
是老夫為了讓人能夠活出真我的經驗之談，
伊織...你很特別，比其他人聰慧許多，
擁有接受新時代的寬容，
尊重舊時代的謹慎，
以和為貴的穩重，
以及能在這些前提下作出合理選擇的直覺，
老夫會收你為養子，正是因為看出你有這樣的才能，
只要善加磨練，將會是上好的"試斬"對象...
其中絕無私情，絕對沒有任何的感情，
可是你的心太軟，
如果換成年輕的武藏，或是...
武藏的指導對你來說只有痛苦，
既然命運如此，當然也只能遵從，
真的是，談何救人啊...
伊織...你生錯時代了啊...
伊織在殘破的長屋被Saber叫醒，此時香耶也來了，香耶把秀麗的Saber認成伊織帶回家的情人，正打算把香耶趕回去的時候，魔法書紅玉也醒了。紅玉之書有著獅鳩做成的書皮和紅寶石的眼睛，是能夠飄浮在空中、與人對話的魔導書，是武藏留下的遺產，伊織先前所使用的寶石魔術也是紅玉所教導。知道了伊織要參加盈月之儀，需要鞏固陣地的魔術工房，在紅玉的指導下一行人完成長屋的改裝。
吃完早餐後，Saber雖然表示既然被盈月所召喚，就不會在意人民與城鎮而已打倒對手為主，但看在伊織的份上會盡量有限度的減少傷害。為了賺取生活費，伊織今天要前往吉原，一路上Saber對熱鬧的江戶城跟路上美食感到興趣亂跑，也對這個時代的太平之世感動。春天的吉原飄著櫻花，透過助之進獲得了保鑣委託，Saber雖然說把對手殺死就好，但伊織要Saber避免無謂的殺生，Saber不解前一天都已經殺過那麼多追兵了，為何此時還說不能殺人，但總之伊織並不打算無謂的奪取他人性命。
完成保鑣任務的Saber一行走在吉原，赫然才發現周圍都沒有人了，此時在櫻花花雨中走來的是花魁道中高尾太夫，在身旁舉傘的是異常魁武的從者，大吼一聲便往兩人襲來。Saber試圖擋住巨漢，伊織則是追著高尾太夫來到無人的區域，卻被雙刀劍士所襲擊，伊織對這個劍法再熟悉不過，在飛揚的塵土中出現的身影是身著華服的師傅: 宮本武藏。
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