《女神異聞錄3》是日本Atlus公司在2006年7月13日於PlayStation 2平台發售的角色扮演遊戲，為《女神轉生系列》的分支《女神異聞錄系列》的第三部本傳作品，本作的主題顏色為「藍色」。
收錄了追加劇情的擴充版《女神異聞錄3 FES》在日本於2007年4月19日發售。
PlayStation Portable版移植作《女神異聞錄3 攜帶版》於2009年推出，針對初版遊戲作了修改，採用了諸多在《女神異聞錄4》中受到好評的設計，並追加了女性主角。
本作是以學園城市為舞台，敘述擁有稱為「人格面具」（Persona）特殊能力的少年少女的角色扮演遊戲。
隨著《女神異聞錄2》的完結，本作採用全新的世界設定、登場人物、遊戲系統及故事背景。遊戲分為白天與朋友一起的學園生活及夜晚與在「影時間」出現的神秘怪物「陰影」（シャドウ，Shadow）的戰鬥。
距離前作發售相隔6年，本作採用全新的設定，加入時間經過與人際關係系統，加重學園的日常生活的部分，故事開始的時間為2009年4月。
除了與前作一樣可以培養Persona 外，本作還可以將Persona 合體成為新的Persona。本作由《真·女神轉生III－Nocturne》的團隊製作，同樣加入技能繼承和技能轉換系統，使Persona的培養更加深入。
戰鬥系統是由《真·女神轉生III》的「Press Turns」戰鬥系統改良，亦而加入女神轉生系統中受歡迎的要素，例如「天鵝絨房間」（ベルベットルーム，Velvet Room）加入「人格面具全書」等。
故事時間為2009年4月。10年前因事故而失去雙親而由親戚養育的主角，因為家庭的事情而轉校到小中一條龍學校「私立月光館學園」的高中部中。
在入住學生宿舍後不久，他被奇形怪狀的怪物「陰影（Shadow）」襲擊，令隱藏在他體內Persona的能力甦醒。因為這個契機，主角被迫知道這個被掩蓋的世界真實的一端。
那就是「影時間」，一天與另一天之間存在著的隱藏時間，「陰影」就是這個影時間的居民。在影時間中，普通人會變成棺柩形的形態，失去這時的記憶（這稱為「象徵化」）。
所以大部分的人都不知道影時間的存在，但有一少部份人，在影時間還保持著人的形態，那些人會被陰影吃掉他們的精神，而成為無力狀態（陰影人）。
在月光館學園理事長幾月修司下，組成使用Persona的陰影討伐部隊「特別課外活動部（S.E.E.S.）」。
得到特殊Persona能力的主角被部長桐條美鶴看中，成為隊員與特別課外活動部的隊長與危害人類的影作戰。
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